DOCENCIA



Working with the human genome sequence y Working with pathogen genomes.
Realizados en centro de Bioinformática Wellcome Trust Advanced Courses, situado en el Instituto de Higiene y creado con la asistencia de profesores de Wellcome Trust Sanger Institute y Cold Spring Harbor Laboratories.
Estudiantes de Uruguay y toda latinoamerica aplican para obtener un lugar con beca completa para la realización de dichos cursos.

Responsable en Uruguay para la organización de ambos cursos anuales:
Dr. Alejandro Chabalgoity.
 
Jornadas Internacionales de toxinas animales y antitoxinas.
Co-organización y asistencia. Noviembre 2009. Departamento de Desarrollo Biotecnológico. Instituto de Higiene. Facultad de Medicina. UDELAR
Responsables: Dra. Patricia Berasain y MSc. Victor Morais.

Seminario Internacional: Desarrollo de adyuvantes para vacunas basados en saponinas de especies nativas latinoamericanas.

Instituto de Higiene - Salón de Seminarios, jueves 24 de setiembre a las 15 hs.
Responsable: Dr. Fernando Ferreira.


Aplicaciones de la PCR en Tiempo Real a la investigación.
Dpto. de desarrollo Biotecnológico – Instituto de Higiene. 29 al 3 de diciembre.
Docentes: Dr. Juan Martín Marqués, MSc. Andrea Rossi y Dra. Lucía Yim.
ENSEÑANZA DE PRE-GRADO
FACULTAD DE CIENCIAS
Curso de Química Orgánica II.

3 horas semanales. Duración total: 28 semanas.
Docente: Dr. Fernando Ferreira.
DOCTORADO:
ENSEÑANZA DE POST-GRADO
Tesis: “Escherichia coli uropatogeno: Epidemiología Molecular, Resistencia a Antibióticos y Patogenia”  Concluida Dic. 2016
Dr. Rafael Vignoli. Orientador: Dr. Alejandro Chabalgotiy.


   PEDECIBA BIOLOGÍA:



   PEDECIBA QUÍMICA:

Tesis: “Búsqueda y Caracterización de Péptidos Antimicrobianos de origen Vegetal”.
MSc. Paola Díaz Dellavalle. Orientador: Dr. Fernando Ferreira.
               MAESTRÍA:


   PEDECIBA BIOLOGÍA:
Tesis: “Bases moleculares de la salmonelosis invasiva causada por cepas de Salmonella no tifoidea”. Concluída May. 2016
Lic. Sebastían Sasías. Orientador: Dra. Lucía Yim. Co-orientador: Gustavo Varela.
Tesis: “Costo Biológico de la expresión de B-lactamasas en Salmonella enterica serovar Typhimurium” (FINALIZADA)
Nicolás Cordeiro. Orientador: Dra. Lucía Yim.
POSGRADO FACULTAD DE QUÍMICA:
Tesis: "Desarrollo de formulaciones de adyuvantes inmunológicos basados en saponinas".
Lic. Leonora Quirici. Orientador Fernando Ferreira.


CURSO DE POSTGRADO PEDECIBA 2011.
Biotecnologías de la Salud: Fundamentos y Aplicaciones

Departamento de Desarrollo Biotecnológico, Instituto de Higiene
Facultad de Medicina, UdelaR.
Docentes Responsables: Dr. J. Alejandro Chabalgoity, Dra. M. Gabriela Kramer.
diseño: lacufre.com  I  armado: biglogobig.com
TESIS FINAL DE CARRERA (en curso)

Curso fisiología hematológica e inmunología básica y aplicada CBCC6.
Participación en el Ciclo Básico clínico Comunitario, módulo 6, de la carrera de Doctor en Medicina, 4to. año. Se realizan 8 actividades de discusiones grupales y tres actividades teóricas, en conjunto con docentes del Departamento de Bacteriología y Virología.

"Caracterización biológica de tumores mamarios inducidos con N-nitrosometilurea en ratas"
Natalia Mazza. Orientador: Dra. María Gabriela Kramer. Co-Orientador: Dra. Patricia Berasain.
“Rol de la flagelina en el efecto antitumoral de Salmonella”.
Amy Mónaco. Orientador: Dra. María Moreno. Co-orientador:
Dr. Alejandro Chabalgoity.
TESIS FINAL DE CARRERA (Ya concluidas)
Tesis: "Uso de nuevas tecnologías para el estudio de la respuesta inmune en rumiantes. Aplicación en la evaluación de la eficacia de vacunas veterinarias"
MSc. Andrea Rossi. Orientador: Dr. Alejandro Chabalgotiy. Coorientador: Dr. Juan Martín Márques
Tesis: "Desarrollo de un modelo pre-clínico de enfermedad mínima residual de Linfomas no Hodgkin y optimización de inmunoterapias" Concluída Abr. 2017
M. Sc. Thais Bascuas. Orientador: Dr. Alejandro Chabalgotiy. Coorientadores: Dras. Sofía Grille y María Moreno
“Desarrollo de vectores para la terapia génica del cáncer basados en Salmonella enterica serovar Typhimurium”
Rodrigo González. Orientador: Dra. María Gabriela Kramer. Co-Orientador: Dr. Alejandro Chabalgoity.


Clases teóricas 2013 dictadas por docentes del Depto.:

Inmunidad frente a bacterias extracelulares. Modelo: Streptococcus pneumoniae.
Teórico


Vacunas: principios de acción y estrategias de desarrollo.
Teórico


Inmunidad de las mucosas frente a infecciones por enteropatógenos: el rol de la microbiota en la infección por Salmonella enterica.
Teórico
Tesis: "Análisis proteómico comparativo en aislamientos de Salmonella no tifoidea: en busca de los determinantes de la invasividad"
Lic. Adriana Martínez. Orientadora: Dra. Lucía Yim. Co-orientadora: Dra. Laura Betancor
Tesis: "Inmunoestimulantes para el tratamiento de RTIs: desarrollo productivo y estudio de las bases celulares y moleculares de su acción terapéutica". (Finalizada 2017).
Lic. Florencia Ferrara. Orientadora: Dra. Analía Rial. Co-orientador: Prof. Alejandro Chabalgoity.

Tesis:
"Evaluación de flagelinas de diversas especies bacterianas como inmunomoduladores en patologías del tracto respiratorio". (Finalizada 2017).
Lic. Lucía Rodríguez. Orientadora: Dra. Lucía Yim. Co-orientador: Prof. Alejandro Chabalgoity.

Tesis:
"Desarrollo de una vacuna polivalente contra Salmonella: el camino hacia alimentos sanos".
Lic. Victoria Pérez. Orientadora: Dra. Laura Betancor. Co-orientadora: Lucía Yim
 
“Evaluación de la ruta sublingual como alternativa para vacunación contra Streptococcus pneumoniae
José María Saavedra. Orientadora: Natalia Muñoz Wolf. Co-orientador: Prof. Alejandro Chabalgoity
“Caracterización de la respuesta inmune anti-Clostridium chauvoei en bovinos ”
Mariana Rivera. Orientador: M. Sc. Andrea Rossi. Co- Orientador: Dr. Alejandro Chabalgoity
"Comparación de la respuesta inmune contra la infección por S. pneumoniae en ratones salvajes y deficientes en IL-17a ”
Paula Céspedes. Orientador: Dr. Juan Martín Marquez. Co- Orientador: Dr. Alejandro Chabalgoity
"Clonaje del promotor CD11b en plásmidos de expresión eucariota y evaluación de su actividad en líneas celulares de origen mieloide y epiteliales".
Agustina Fontes. Orientadora: Dra. Gabriela Kramer
Curso optativo de Facultad de Medicina: Bases Inmunológicas de la Vacunación
Responsables: Dra. María Moreno y Prof. Alejandro Chabalgoity

Ver Programa 2017


   MAESTRÍA EN BIOTECNOLOGÍA:
Tesis: "Obtención y producción de formas recombinantes de toxinas de Clostridium botulinum C y D para uso como vacunas de nueva generación"
Dr. Julio Guarnaschelli. Orientador: Prof. Alejandro Chabalgoity. Co-orietadora: Dra. Lucía Yim.

   DOCTORADO EN BIOTECNOLOGÍA:
EXTENSIÓN UNIVERISTARIA
Programa Acortando Distancias (ANII 2014) Estudiante: Gabriel Geninazzi. Responsable Facultad de Químicas: Dra. Gianella Facchin. Responsable Fac. Medicina: Dra. M. Gabriela Kramer
Tesis: "Caracterización de la invasión y del efecto antitumoral de cepas atenuadas de Salmonella Typhimurium en un modelo de cáncer de mama metastásico" (Finalizada 2015).
Lic. Martín Masner. Orientador: Dra. M. Gabriela Kramer. Co-orientador: Dr. Alejandro Chabalgoity
Vectores Virales para la Expresión de Genes Foráneos en Células Eucariotas
Unidad de Virología, Facultad de Ciencias, UdelaR
Departamento de Desarrollo Biotecnológico, Instituto de Higiene, Facultad de Medicina, UdelaR
Docentes Responsables: Dra. Mabel Berois y Dra. M. Gabriela Kramer
Tesis: "Salmonella como base para inmunoterapia contra melanoma" (Finalizada 2015).
Lic. Amy Mónaco. Orientador: Dra. María Moreno. Co-orientador: Dr. Alejandro Chabalgoity
Tesis: "Estudio de los mecanismos celulares y moleculares anti melanoma inducidos por Salmonella "
MSc. Amy Mónaco. Orientador: Dra. María Moreno. Coorientador: Dr. Alejandro Chabalgoity
Tesis: “Caracterización fisicoquímica de la adsorción de proteínas a micropartículas de carbonato de calcio modificadas superficialmente con fosfato y su evaluación como adyuvante de inmunización”.
Lic. Geraldine Rimsky. Orientador: Dr. Alejandro Chabalgoity. Coorientadora: Dra. María Moreno e Iris Miraballes


   PROINBIO:
Tesis: “Desarrollo de nuevas estrategias para el tratamiento de melanoma utilizando Salmonella viva atenuada” (FINALIZADA Feb. 2015)
Dra. Magdalena Vola.  Orientadora: Dra. María Moreno. Coorientadora: Dra. Caroline Agorio
“Evaluación de métodos moleculares como reemplazo a la serotipificación clásica de Salmonella enetrica
Julieta Bisio. Orientadora: Dra. Laura Betancur.
"Proteínas de secreción y su rol adaptativo en el phylum Platyhelminthes: aproximación desde la genómica comparativa".
Mauricio Langleib. Orientadora: Dr. Andrés Iriarte
"Genómica comparativa de elementos genéticos vinculados a la regulación mediada por ARNs no codificantes pequeños en Salmonella enterica".
Lucía Balestrazzi. Orientador: Dr. Andrés Iriarte
Tesis: "Estudio de los mecanismos de accio´n y de la respuesta inmune desencadenada por adyuvantes particulados basados en saponinas de la especie nativa Quillaja brasiliensis."
Lic. Mariana Rivera. Orientador: Dr. Fernando Silveira. Co-orientador: Dra. María Moreno
biotec@higiene.edu.uy
     Cursos 2018

El curso está dirigido a estudiantes motivados de Maestría y Doctorado pertenecientes a instituciones académicas, con conocimientos básicos en Microbiología y Biología Molecular. Se seleccionarán participantes con antecedentes previos en disciplinas diversas relacionadas a los patógenos de plantas y animales, para permitir el aprendizaje mutuo a través de interacciones grupales y discusiones de trabajo.

Carga horaria:  80 horas (32h teóricos, 48h prácticos de laboratorio, prácticos de bionformática y talleres). Evaluación final escrita

Formulario de inscripción: https://goo.gl/forms/n8zk4qL4fbfIMYGj2
mail: escuelamicrobiologia2018@gmail.com
Contenido del programa y cronograma en este link

Introducción a la línea de comandos y a la programación
para análisis bioinformáticos.
Edición Agosto 2018

Montevideo, 30 de Julio al 16 de Agosto de 2018
Departamento de Desarrollo Biotecnológico IH, FMed, UdelaR
Como resultado de los avances en la tecnología de secuenciación se ha generado una revolución en diversas áreas de la biología. Estás metodologías generan una enorme cantidad de información, genomas completos, genes e incluso permite estimar con precisión sus niveles de expresión. Por sus características estos datos sólo pueden ser analizados mediante herramientas bioinformáticas. Muchas de estas herramientas se desarrollan sin una interfaz gráfica, y las que la tienen suelen desarrollarse más lentamente o en versiones no actualizadas. Adquirir manejo en su entorno es fundamental para lograr un uso eficiente de las mismas. Este curso plantea introducir a los estudiantes en la línea de comando, elemento básico para el análisis de secuencias, genomas y datos de secuenciación masiva, y en a la programación. El curso está orientado a estudiantes avanzados de grado y estudiantes de posgrado de áreas biológicas sin formación en programación o bioinformática.
Link al Programa
Carga horaria:  80 horas (32 h teóricos, 48 h prácticos de laboratorio, prácticos de bionformática y talleres) Evaluación final escrita
Docente Coordinador: Dr. Andrés Iriarte

Docentes participantes:
Dr. Guillermo Lamolle, Dr. Pablo Smircich, Dr. Francisco Peñagaricano (vía web)  & Dr. Héctor Musto
Docentes colaboradores: Mag. Eugenio Jara, Mag. Javier Calvelo.

Contacto: airiarte@higiene.edu.uy //
                  airiarteo@gmail.com
Web: www.higiene.edu.uy/ddbp/Andres/
Palabras claves: Linux, Biología computacional, Programación.

Fecha:  30 de Julio al 16 de Agosto.
Lugar: Sala de Bioinformática “Carlos Hormaeche”, Instituto de Higiene.
Horario: 9:00 – 13:30 hs.
Carga Horaria: Teóricos 21 hs. // Prácticos 39 hs. // Evaluación 3 hs.
Créditos: 8 (PEDECIBA).
Cupos: 15.
INSCRIPCIONES ABIERTAS PARA CURSOS DE POSGRADO:

V Escuela Regional de Microbiología
Links de interés
Application: https://coursesandconferences.wellcomegenomecampus.org/events/item.aspx?e=727
Application deadline: 1st August
Aplicaciones de la PCR en Tiempo Real a la Investigación 2018
20 al 24 de Agosto 2018

Curso orientado a estudiantes de Postgrado.
Depto. de Desarrollo Biotecnológico - Instituto de Higiene.

Docentes: Dr. Juan Martín Marqués, Dra. Lucía Yim y MSc. Andrea Rossi

Inscripciones abiertas hasta el 05/08/18!

Enviar el formulario de inscripción  a
biotec@higiene.edu.uy

Formulario de Inscripción

Programa 2018
Docentes Coordinadoras:
Dra María Inés Siri, Dra Lucía Yim, Dra Laura Betancor, Dra María Julia Pianzzola

Docentes extranjeros invitados:
Dr. Leonardo De La Fuente (Universidad de Auburn, USA)
Dr. Mario Feldman (Washinghton University, USA)
Dr. Saúl Burdman (Hebrew University, Israel)
Dr. Joao Setubal (Universidad de San Pablo, Brasil)
Dra. Eleonora García Véscovi (Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario, CONICET-Universidad Nacional de Rosario, Argentina)


Docentes nacionales:
Andrés Iriarte, Paola Scavone, Analía Rial, Alejandro Chabalgoity, Luciana Robino, Lorena Pardo, María Inés Lapaz, Virginia Ferreira, Valentina Croce,  Adriana Martínez.