SLFinder es un pipeline de análisis bioinformáticos en cuatro pasos, ideado para identificar secuencias de Spliced Leaders (pSL) a partir de ensamblados de novo de transcriptomas. El mismo no hace uso de secuencias SL conocidas y requiere mínima manipulación manual de los datos por parte del usuario.
Instalación y Uso
Para instalar y hacer uso de SLFinder, por favor siga los pasos detallados en la página GitHub del programa.
Cita bibliográfica
Si utiliza SLFinder en su trabajo, por favor cite la siguiente publicación:
Calvelo, J., Juan, H., Musto, H. et al. SLFinder, a pipeline for the novel identification of splice-leader sequences: a good enough solution for a complex problem. BMC Bioinformatics 21, 293 (2020). https://doi.org/10.1186/s12859-020-03610-6
Calvelo, J., Juan, H., Musto, H. et al. SLFinder, a pipeline for the novel identification of splice-leader sequences: a good enough solution for a complex problem. BMC Bioinformatics 21, 293 (2020). https://doi.org/10.1186/s12859-020-03610-6