Me uní al Laboratorio de Biología Computacional en 2017 (siendo estudiante de grado), motivado por el curso de introducción a la línea de comandos para análisis bioinformáticos que dicta el Laboratorio.

Desde entonces he estado trabajando en dos líneas de investigación: i) el estudio de duplicaciones linaje-específicas dentro de familias multigénicas en organismos del phylum Platyhelminthes; y ii) el etsudio del transcrptoma de las etapas de desarrollo intracaracol del tremátodo parásito F. hepatica.

El trabajo realizado en la primera de estas líneas es parte de un proyecto financiado por la ANII. Con el mismo realicé mi tesina de grado para la obtención del título de Licenciado en Bioquímica. Nos focalizamos en el estudio de duplicaciones linaje-específicas (i.e. inparálogos) existentes en los genomas de treinta platelmintos, en su enorme mayoría parásitos. Este conjunto de genes duplicados muestra un enriquecimiento en genes codificantes para proteínas relacionadas con la interacción de parásitos con sus respectivos hospederos, así como posibles marcas de evolución bajo régimen de selección natural a nivel de secuencia y, en algunos casos, expresión específica ya sea a nivel de una etapa de desarrollo o en un tejido en particular. En la actualidad nos encontramos culminando la escritura de un manuscrito que recopila este trabajo, el cual esperamos publicar en una revista arbitrada en un futuro no lejano.

La segunda línea de investigación está vinculada a mi trabajo de Maestría, el cual realizo bajo la orientación de los Dres. José F. Tort ( Departamento de Genética - Facultad de Medicina (Universidad de la República)) y Andrés Iriarte (Laboratorio de Biología Computacional). El objetivo del trabajo es la caracterización del transcriptoma de las etapas larvarias de desarrollo del tremátodo F. hepatica que se desarrollan dentro de uno de sus hospederos intermedios caracol, L. viatrix. Las mismas son etapas cruciales en el desarrollo de este parásitos, dado que durante las mismas se lleva a cabo un rpoceso de expansión clonal asexual que termina generando una gran cantidad de cercarias, capaces en última instancia de infectar a los hospederos finales mamíferos. Interesantemente, a la fecha existen datos transcriptómicos referentes a etapas de desarrollo intracaracol de otros tremátodos (como lo son S. mansoni y F. gigantica), pero no existen estudios referentes a estas etapas para F. hepatica. Estudios comparativos de los niveles de expresión de miembros pertenecientes a familias multigénicas en estos parásitos pueden permitir dilucidar patrones conservados y específicos que permitan comprender la compleja interacción de estos parásitos con sus huéspedes intermedios.

Por último debo agregar que desde mi unión al Laboratorio he realizado también algunas colaboraciones en calidad de co-autor con investigadores locales de otros campos de estudio (principalmente de la microbiología), en los cuales he ayudado en análisis tales como el ensamblado de genomas de cepas no descritas de microorganismos.

Publicaciones destacadas

• Langleib M., Beracochea M., Zabaleta M., Battistoni F., Sotelo-Silveira J., Fabiano E., Iriarte A., & Platero P. Draft genome sequence of Paraburkholderia sp. UYCP14C, a rhizobium strain isolated from root nodules of Calliandra parvifolia (MRA00173-19R2). Microbiology Resource Announcements 8(16) e00173-19. doi: 10.1128/MRA.00173-19

• Machin E.V., Asem M. D., Salam N., Iriarte A., Langleib M., Li W-J., & Menes R.J. Nesterenkonia natronophila sp. nov., an alkaliphilic actinobacterium isolated from a soda lake, and emended description of the genus Nesterenkonia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 69:7. doi: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.003409

• Menes R.J., Machin E.V., Iriarte A. & Langleib M. Bacillus natronophilus sp. nov., an alkaliphilic bacterium isolated from a soda lake. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70(1):562-568. doi: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.003792