Mis líneas de trabajo a la fecha son:

• Genómica funcional de Salmonella Enteritidis y Salmonella Derby como patógenos alimentarios relevantes. Las enfermedades transmitidas por los alimentos son uno de los problemas de salud pública que se presentan con mayor frecuencia en la población. La salmonelosis es una enfermedad transmitida por los alimentos de distribución mundial. Salmonella, en particular la especie S. enterica, es un patógeno alimentario importante que genera grandes problemas en la salud pública. El serotipo de S. enterica asociado con enfermedades transmitidas por alimentos más comúnmente aislado en todo el mundo es S. enterica serovar Enteritidis (S. Enteritidis). Durante 1995-2001, Uruguay enfrentó una epidemia de salmonelosis causada principalmente por S. Enteritidis. Sorprendentemente, S. Derby se aisló en alimentos, pero no en infecciones humanas. Con frecuencia, S. Derby también se aísla como patógeno de salmonelosis. Sin embargo, la situación epidemiológica actual de la salmonelosis sigue siendo alarmante debido a varios brotes a nivel nacional. Debido a la actual situación epidemiológica local y regional, es urgente conocer en profundidad los mecanismos moleculares que contribuyen al éxito de S. Enteritidis y S. Derby como patógeno de enfermedades de transmisión alimentaria. En 2019 iniciamos un proyecto científico como parte de mi proyecto postdoctoral en Montevideo (Uruguay). Realizo estudios genómicos funcionales de aislados de S. Derby y S. Enteritidis de infección humana y fuentes de huevos.

• Predicción de elementos genéticos móviles mediante algoritmos de aprendizaje automático. La idea de que muchos genomas procarióticos son mosaicos, compuestos de una “columna vertebral del genoma central” de genes esenciales y de mantenimiento (el genoma central) intercalados con segmentos de ADN que constituyen el “mobiloma” (una variedad de genes accesorios que forman parte del genoma), es ahora moneda común. El mobiloma abarca varios tipos de unidades genéticas que, como indica su nombre colectivo, pueden moverse de un lugar a otro en un genoma particular o de una célula a otra. Estos elementos genéticos móviles (MGE) se pueden dividir en dos grupos principales: aquellos, como los plásmidos y bacteriófagos, que son transmisibles de una célula a otra (la MGE intercelular), y aquellos que no pueden ser transferidos por sí mismos pero que se transfieren después de la integración en miembros del primer grupo (el intracelular MGE). La MGE intracelular o los elementos transponibles (TE) incluyen transposones (Tn) y secuencias de inserción (IS) pero pueden incluir integrones (In) e intrones. Actualmente, estamos desarrollando software bioinformático para predecir la presencia de SI mediante métodos de aprendizaje automático. Estamos creando un conjunto de datos bien hecho de IS a partir de la base de datos ISFinder y enriqueciéndolo con la base de datos GenBank. A este conjunto de datos se le permitirá entrenar el algoritmo para predecir la presencia y clasificar de IS en un genoma diferente. El proyecto es parte de la tesis de Maestría en Minería de Datos (Universidad de Buenos Aires, Argentina) del alumno Miguel Angel Barros del que fui mentor.

• Epidemiología molecular y mecanismo de resistencia a los antimicrobianos en patógenos gram-negativos. Las bacterias gramnegativas causan infecciones que incluyen neumonía, infecciones del torrente sanguíneo, infecciones de heridas o del sitio quirúrgico y meningitis en entornos de atención médica. Las bacterias gramnegativas son resistentes a múltiples fármacos y son cada vez más resistentes a la mayoría de los antibióticos disponibles. Estas bacterias tienen capacidades integradas para encontrar nuevas formas de ser resistentes y pueden transmitir materiales genéticos que permiten que otras bacterias también se vuelvan resistentes a los medicamentos. Estudio la evolución genómica y epidemiología de diferentes patógenos gramnegativos. Además, estudio la resistencia a los antimicrobianos y el mecanismo de virulencia de patógenos gramnegativos utilizando enfoques genómicos y bioinformáticos.

• Dinámica evolutiva de Burkholderia contaminans durante la infección crónica en paciente con fibrosis quística. El complejo Burkholderia cepacia (Bcc) es un grupo de más de 20 especies bacterianas estrechamente relacionadas19. La infección por Bcc se asocia con una disminución acelerada de la función pulmonar y del índice de masa corporal, así como un mayor riesgo de mortalidad con respecto a otros patógenos asociados con pacientes con FQ. Esta disminución fatal cuando el paciente está infectado con Bcc se conoce como “síndrome de cepacia” y no se ha observado con ningún otro patógeno asociado con la FQ. Los determinantes clave asociados con este síndrome siguen siendo desconocidos; Los aislamientos de Bcc se pueden recuperar de pacientes con o sin síndrome de cepacia, lo que sugiere que tanto los factores bacterianos como los del huésped juegan un papel importante en la determinación del pronóstico clínico. Los pacientes con FQ que presentan una infección crónica por Bcc tienen un mayor riesgo de mortalidad y una menor probabilidad de erradicar dicho patógeno, por lo que tienen una menor probabilidad de ser incluidos en los programas de trasplante pulmonar. Estudio la dinámica evolutiva de B. contaminans durante la infección crónica en un paciente con fibrosis quística.

Publicaciones destacadas

• Traglia GM, Place K, Dotto C, Fernandez JS, Montaña S, Bahiense CDS, Soler-Bistue A, Iriarte A, Perez F, Tolmasky ME, Bonomo RA, Melano RG, Ramírez MS. INTERSPECIES DNA ACQUISITION BY A NATURALLY COMPETENT Acinetobacter baumannii STRAIN. Int J Antimicrob Agents. 2019 Apr;53(4):483-490. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2018.12.013. Epub 2019 Jan 3.

• Traglia G, Chiem K, Quinn B, Fernandez JS, Montaña S, Almuzara M, Mussi MA, Tolmasky ME, Iriarte A, Centrón D, Ramírez MS. GENOME SEQUENCE ANALYSIS OF AN EXTENSIVELY DRUG-RESISTANT Acinetobacter baumannii INDIGO-PIGMENTED STRAIN DEPICTS EVIDENCE OF INCREASE GENOME PLASTICITY. Sci Rep. 2018 Nov 16;8(1):16961. doi: 10.1038/s41598-018-35377-5.

• Traglia GM, Quinn B, Schramm ST, Soler-Bistue A, Ramirez MS. SERUM ALBUMIN AND CA2+ ARE NATURAL COMPETENCE INDUCERS IN THE HUMAN PATHOGEN Acinetobacter baumannii. Antimicrob Agents Chemother. 2016 Jul 22;60(8):4920-9. doi: 10.1128/AAC.00529-16. Print 2016 Aug.

• Quinn B, Rodman N, Jara E, Fernandez JS, Martinez J, Traglia GM, Montaña S, Cantera V, Place K, Bonomo R, Iriarte A, Ramirez MS. HUMAN SERUM ALBUMIN ALTERS SPECIFIC GENES THAT CAN PLAY A ROLE IN SURVIVAL AND PERSISTENCE IN Acinetobacter baumannii. Scientific Reports. 2018 sept. doi:

• Adams MD, Pasteran F, Traglia GM, Martinez J, Huang F, Liu C, Fernandez JS, Lopez C, Gonzalez LJ, Albornoz E, Corso A, Vila AJ, Bonomo RA, Ramirez MS. DISTINCT MECHANISMS OF DISSEMINATION OF NDM-1 METALLO-Β-LACTAMASE IN Acinetobacter SPECIES IN ARGENTINA. Antimicrob Agents Chemother. 2020 Apr 21;64(5):e00324-20. doi: 10.1128/AAC.00324-20.

• Ramirez MS, Traglia GM, Lin DL, Tran T, Tolmasky ME. PLASMID-MEDIATED ANTIBIOTIC RESISTANCE AND VIRULENCE IN GRAM-NEGATIVES: THE Klebsiella pneumoniae PARADIGM. Microbiol Spectr. 2014;2(5):1-15. doi: