Actualmente, en el marco de mi proyecto de Doctorado me encuentro trabajando en una línea de investigación la cual se basa en el estudio de la FBN en $\alpha$ y $\beta$ proteobacterias. Los rizobios son bacterias que fijan nitrógeno gaseoso ($N_2$) después de haberse establecido endosimbióticamente en nódulos, generalmente radiculares, de leguminosas. Estas bacterias forman un conjunto filogenéticamente diverso ubicado dentro de las alfa y beta-proteobacterias, siendo las últimas las menos estudiadas.

Describir y entender los cambios linaje-específicos ocurridos en el genoma de diferentes rizobios es fundamental para entender cabalmente el proceso de FBN en simbiosis. Este proyecto específicamente pretende entender el proceso de fijación biológica de nitrógeno (FBN) en $\beta$-rizobios, con especial énfasis en procesos genéticos vinculados con el reconocimiento de la planta hospedera y la nodulación, utilizando una herramienta de transcriptómica, el RNAseq. Par ello se utilizará como modelo de estudio un rizobio del género Cupriavidus, aislado previamente en nuestro laboratorio y como hospedero de nodulación una especie del género Mimosa.

Se plantea el análisis de RNAseq en tres estadíos claves en el proceso de simbiosis.La identificación de los genes con expresión diferencial obtenidos, así como la inmediata caracterización que surge naturalmente de las rutas metabólicas y/o sistemas relacionados, nos permitirán entender con más profundidad el proceso biológico. Con los datos obtenidos se plantea determinar las similitudes y las diferencias entre las asociaciones establecidas entre $\alpha$ y $\beta$-rizobios con sus leguminosas hospederas.

Publicaciones destacadas

• Improved glycerol to ethanol conversion by E. coli using a metagenomic fragment isolated from an anaerobic reactor, 2016 LOÁCES, I. , RODRIGUEZ, C. , AMARELLE, V. , FABIANO, E , NOYA, F doi:

• Est10: A Novel Alkaline Esterase Isolated from Bovine Rumen Belonging to the New Family XV of Lipolytic Enzymes (Completo, 2015) RODRIGUEZ, C. , LOÁCES, I. , AMARELLE, V , SENATORE, D , IRIARTE, A. , FABIANO, E , NOYA, F PLoS ONE, 2015. doi: