{"id":9244,"date":"2023-05-29T11:02:30","date_gmt":"2023-05-29T14:02:30","guid":{"rendered":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/?p=9244"},"modified":"2023-05-29T11:02:31","modified_gmt":"2023-05-29T14:02:31","slug":"secuenciacion-de-genomas-completos-nuevo-equipamiento-illumina-miniseq-tm-sequencing-system","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/2023\/05\/29\/secuenciacion-de-genomas-completos-nuevo-equipamiento-illumina-miniseq-tm-sequencing-system\/","title":{"rendered":"Secuenciaci\u00f3n de genomas completos: nuevo equipamiento: Illumina MiniSeq TM Sequencing System."},"content":{"rendered":"\n<p>El Depto. de Bacteriolog\u00eda y Virolog\u00eda, perteneciente a la Facultad de Medicina, se encuentra conformado por un grupo multidisciplinario, cuyo fin es desarrollar tareas de ense\u00f1anza, investigaci\u00f3n y extensi\u00f3n dentro del \u00e1rea de la microbiolog\u00eda.<\/p>\n\n\n\n<p>A partir del 2022, se ha adquirido un secuenciador Illumina MiniSeq TM Sequencing System, equipo de pr\u00f3xima generaci\u00f3n (NGS), capaz de realizar una lectura automatizada de ADN o ARN y posterior an\u00e1lisis de datos en una plataforma BaseSpace TM . Actualmente, este equipo lo est\u00e1 gestionando el Laboratorio de Resistencia a Antibi\u00f3ticos para la realizaci\u00f3n de secuenciaci\u00f3n de genomas completos en el marco de diversos proyectos bajo el lema de \u201cUna Salud\u201d. Este lema se encuentra en l\u00ednea con lo establecido por la tripartita OMS, FAO y OMSA (previamente OIE) que considera que la resistencia a los antimicrobianos (RAM) debe tener un abordaje integral y multidisciplinario, siendo uno de los pilares del enfoque \u201cUna Salud\u201d establecido por dichas organizaciones. Es as\u00ed que se han procesado y<br>analizado genomas completos de bacilos Gram negativos multi-resistentes aislados de peque\u00f1os animales y animales de producci\u00f3n, as\u00ed como de muestras cl\u00ednicas humanas, estos \u00faltimos correspondientes a aislamientos individuales o en contexto de diversos brotes, ya sea de Enterobacterales y Pseudomonas spp productoras de \u03b2-lactamasas de espectro extendido, carbapenemasas y\/o resistentes a colistina, entre otras. <\/p>\n\n\n\n<p>Otra aplicaci\u00f3n de esta metodolog\u00eda es la comparaci\u00f3n gen\u00f3mica bacteriana, an\u00e1lisis de genes metab\u00f3licos y de virulencia, obtenidos a partir de muestras cl\u00ednicas o de alimentos involucrados en brotes alimentarios. Es por ello que, recientemente, se ha comenzado con la secuenciaci\u00f3n de genomas completos de Listeria monocytogenes obtenidas a partir de seres humanos y alimentos. <\/p>\n\n\n\n<p>Nuestro Departamento ha participado en distintas instancias en el proyecto internacional \u201cTrabajando juntos para combatir la resistencia a los antimicrobianos\u201d impulsado por la tripartita y financiado por la Uni\u00f3n Europea. En este contexto realizamos el \u201cTaller te\u00f3rico-pr\u00e1ctico de detecci\u00f3n fenot\u00edpica y gen\u00f3mica de la resistencia a los antimicrobianos en el marco de \u201cUna Salud\u201d, destinado a la capacitaci\u00f3n de personal t\u00e9cnico de los laboratorios de referencia oficiales de los 8 pa\u00edses involucrados en el estudio de la RAM (Uruguay, Argentina, Brasil, Chile, Colombia, Paraguay y Per\u00fa). <\/p>\n\n\n\n<p>Por otro lado, organizamos la VII Escuela Regional de Microbiolog\u00eda: Estudio y vigilancia de la resistencia a antimicrobianos en el marco de \u201cUna Salud\u201d donde recibimos estudiantes de postgrado de Per\u00fa, Paraguay, Chile, Argentina y Uruguay. Ambas actividades incluyeron la secuenciaci\u00f3n de genomas completos en el secuenciador disponible y la formaci\u00f3n en an\u00e1lisis de resultados geno y fenot\u00edpicos de genes de RAM de importancia cr\u00edtica para la salud humana a partir de aislamientos de inter\u00e9s, brindando herramientas que permitan su detecci\u00f3n y vigilancia en diferentes sectores: salud humana, veterinaria, industria, entre otros.<br>Dentro del equipo docente, adem\u00e1s de integrantes de nuestro departamento, participaron docentes del Depto. de Desarrollo Biotecnol\u00f3gico, as\u00ed como con docentes extranjeros de la Universidad de Buenos Aires, Universidad Complutense de Madrid y oficial t\u00e9cnico de la OPS, y conto con el apoyo y auspicio de la American Society for Microbiology, Ministerio de Salud P\u00fablica, FAO, OPS, OIE, PEDECIBA y Sociedad Uruguaya de Microbiolog\u00eda. <\/p>\n\n\n\n<p>Los datos generados por este equipo son de utilidad para comprender los mecanismos por los cuales estos agentes persisten en distintos \u00e1mbitos y producen da\u00f1o en los seres humanos.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-gallery columns-1 is-cropped wp-block-gallery-1 is-layout-flex wp-block-gallery-is-layout-flex\"><ul class=\"blocks-gallery-grid\"><li class=\"blocks-gallery-item\"><figure><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"664\" src=\"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia-1024x664.jpg\" alt=\"\" data-id=\"9246\" data-full-url=\"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia.jpg\" data-link=\"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/?attachment_id=9246\" class=\"wp-image-9246\" srcset=\"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia-1024x664.jpg 1024w, https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia-300x195.jpg 300w, https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia-768x498.jpg 768w, https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia-1536x996.jpg 1536w, https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-content\/uploads\/sites\/2\/2023\/05\/depto-bacteriologia.jpg 1600w\" sizes=\"(max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/figure><\/li><\/ul><\/figure>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>El Depto. de Bacteriolog\u00eda y Virolog\u00eda, perteneciente a la Facultad de Medicina, se encuentra conformado por un grupo multidisciplinario, cuyo&#8230;<\/p>\n","protected":false},"author":11,"featured_media":9245,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-9244","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-departamento-de-bacteriologia-y-virologia"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9244","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/users\/11"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=9244"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9244\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":9247,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9244\/revisions\/9247"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/media\/9245"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=9244"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=9244"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/higiene.edu.uy\/bacteriologia-y-virologia\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=9244"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}